аЯрЁБс>ўџ .0ўџџџ-џџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџьЅСБ@ јП›jbjb˜ ˜ ђhђh›џџџџџџlZZZZZ fZЕ 0†œœœœœœœr t t t t t t ,х    œœœœœ  Ќœœ†ЌЌЌœFœœr Ќ*Bœr ЌЦЌr r z ;ЩСZZтЪr r Е Е r ЅЌЅr ЌУхSTAT 287 Seminar in Statistical Gene Expression Analysis and Systems Biology Ker-Chau Li , MS 8959 e-mail:  HYPERLINK "mailto:kcli@stat.ucla.edu" kcli@stat.ucla.edu This is a course offers students a quick entry to cutting edge genomics researches from the statistical data analytic point of view. With high-throughput technologies such as genomic sequencing, microarray gene expressions, Chromatin-ImmunoPrecipitation DNA chip (ChIP-chip), mass spectrometry (MS/MS) proteomics, scientists are collecting genetic, genomic, and pathway data at rates far beyond the imagination a decade ago. However, such gigantic volume of data produced cannot be analyzed and understood without highly sophisticated computational methods guided by mathematical and statistical principles. Textbook: None Credit Units : 2 Requirement: Statistics background covering the core materials of STAT 100A,B or equivalent courses is require. The class will meet once a week for two hours. The first half of the course will focus on the introduction of the basic biological concepts, description of genomic data, mathematical and statistical models and computational approaches. For the second half of the course, selective research topics will be enforced by in-depth critical review of the current literature. There are no exams for this course. Grading is based on class attendance, group discussion, presentation of course materials and a term paper, with the suggestive weights of 20%, 20%, 30%, 30%. The following gives a list of sample topics by weeks. Week 1: Cells, Genes, and gene expression. Week 2: Clustering and classification for gene functional annotation, and tumor subtype discovery, I. Week 3: Clustering and classification for gene functional annotation, and tumor subtype discovery, II. Week 4: The method of liquid association for gene expression analysis Week 5: Metabolic pathway study Week 6; Transcription factor binding study Week 7: Anticancer drugs and gene expression study Week 8: Multilevel networking and systems biology ( and genetic genomics) Week 9: MicroRNA profiling and cancer prognosis. Week 10: Student project summaries. op—˜™ЋЌЎЏ67;<Lќ§>BOP[ŸЃ­Ў ˜™›їђъђчђїхркргЫгЫгЫгЫгЫгЫгЫгрKHOJQJo( KHOJQJ OJQJo(OJQJ50JjU jUOJPJQJnH OPЎЏ67  $ 6 Љ Њ к л * + ё ђ ) * W У + r ” С ѕ @їїїѕѕѕѕѕѕѕѕѕѕѕѕѕѕѕѕѕѕѕѕѕѕѕѕѕd№1$H$OP[^gopq{|ƒ•–—˜™ЋЌ­ЎЏ67  $ 6 Љ Њ к л * + ё ђ ) * W У + r ” С ѕ @s—˜™š›§§ћћћћћћћћћћћћћћћћћћ§3@s—˜™š›§§§ю§§$„ddдўH$UDS]„da$Аа/ Ар=!А"А# $ %АЯDаЩъyљКЮŒ‚ЊKЉ kcli@stat.ucla.eduрЩъyљКЮŒ‚ЊKЉ 4mailto:kcli@stat.ucla.edu i4@ёџ4NormalCJOJPJQJmH <A@ђџЁ<Default Paragraph FontH@ђH Comment Textdh1$H$OJPJQJnH(U@Ђ( Hyperlink>*B*›џџџџ џџ z™ џџ z™˜››@› › o˜Ћ›Xџ€gmuœЏКОHP P­ощФЫ+2v~лхœЄМХ~‡щђ>H…“šЋH[:::::::::::::::џџ Ker Chau LiRMacintosh HD:Users:kerchau:Desktop:other-files:courses:stat 287:STAT 287 Syllabus Ker Chau LiXMacintosh HD:Users:kerchau:Documents:Microsoft User Data:AutoRecovery save of STAT 287 S Ker Chau LiXMacintosh HD:Users:kerchau:Documents:Microsoft User Data:AutoRecovery save of STAT 287 S Ker Chau LiXMacintosh HD:Users:kerchau:Documents:Microsoft User Data:AutoRecovery save of STAT 287 S Ker Chau LiRMacintosh HD:Users:kerchau:Desktop:other-files:courses:stat 287:STAT 287 Syllabus Ker Chau LiXMacintosh HD:Users:kerchau:Documents:Microsoft User Data:AutoRecovery save of STAT 287 S Ker Chau LiXMacintosh HD:Users:kerchau:Documents:Microsoft User Data:AutoRecovery save of STAT 287 S Ker Chau LiXMacintosh HD:Users:kerchau:Documents:Microsoft User Data:AutoRecovery save of STAT 287 S Ker Chau LiRMacintosh HD:Users:kerchau:Desktop:other-files:courses:stat 287:STAT 287 Syllabus Ker Chau LiXMacintosh HD:Users:kerchau:Documents:Microsoft User Data:AutoRecovery save of STAT 287 Sџ@€ggДœ"g^гdБ­›` @GTimes New Roman5€Symbol3 Arial3TimesEˆ PMingLiUTimes 1ˆ№аhђЂЊІIБFn-Жa#№ЅРДД€0d=щ@№џџ%STAT 287 Seminar in Gene expreression Ker Chau Li Ker Chau Liўџ р…ŸђљOhЋ‘+'Гй0|ˆРЬрьќ  8 D P\dlt'&STAT 287 Seminar in Gene expreressionofTAT Ker Chau Lier Normalu Ker Chau Li8r Microsoft Word 10.1@ш]@Є?э€єЦ@ЮQНщ3Ч-Жўџ еЭеœ.“—+,љЎDеЭеœ.“—+,љЎl( hp˜ ЈА ИРШа и 'UCLA Department of Statisticsl=r &STAT 287 Seminar in Gene expreression TitleД 8@ _PID_HLINKS'Alvnmailto:kcli@stat.ucla.eduЈ0 ўџџџўџџџўџџџ !"#$ўџџџ&'()*+,ўџџџ§џџџ/ўџџџўџџџўџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџRoot Entryџџџџџџџџ РFЛ_АІ3Ч1€Data џџџџџџџџџџџџ 1TableџџџџWordDocumentџџџџSummaryInformation(џџџџџџџџџџџџDocumentSummaryInformation8џџџџџџџџ%CompObjџџџџџџџџџџџџXџџџџџџџџџџџџўџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџўџџџџџ РFMicrosoft Word DocumentўџџџNB6WWord.Document.8